سلام جناب دانش عزیز
خود پروتوکل ftp در لایه اپلیکیشن قرار داره منتهی ورژن امنی هم از این پروتکل تحت عنوان sftp وجود داره و یا اینکه انتقال اطلاعات ftp می تونه رمزنگاری بشه که در این حالت پروتکل های ssl یا tls برای رمزنگاری استفاده میشه که توی لایه پرزنتیشن هستند.
با این دلیل هست که احتمالا چنین چیزی رو دیدید.